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（一） 啟動程序不同

醫療技術鑒定是由屬地的衛生行政部門委托啟動鑒定程序，解決是否屬于醫療事故的問題，是否賠償調解問題。醫療技術鑒定可由雙方當事人共同委托啟動鑒定程序，給雙方當事人一個“說法”，雙方當事人共同委托的鑒定屬于自行鑒定。司法鑒定是獨立于行政鑒定和自行鑒定之外的一種鑒定，由雙方當事人共同申請，由法官啟動。

（二）鑒定人員組成不同

醫療鑒定人員由屬地省級醫學會組建省級醫學專家庫，地市級醫學會組建屬地的市級醫學專家庫，鑒定人員是醫學專家。司法鑒定人員是由司法機構的法醫主持鑒定，聘請臨床醫學專家參與。

（三）鑒定的組織者不同

醫療鑒定由屬地的醫學會負責組織，并承擔鑒定事務，司法鑒定組織者是屬地的司法鑒定機構。

（四）鑒定的內容與目的有不同

醫療鑒定多注重是否屬于醫療事故的認定，司法鑒定重在解決醫療行為是否有過錯，這種過錯與損害后果是否有因果關系。

（五）鑒定的監督機制不同

醫療鑒定的監督：一是由屬地的醫學會對鑒定專家進行資格審查，二是屬地衛生局對專家出具的鑒定文書進行審查，三是屬地的上級衛生行政部門再次組織鑒定。司法鑒定的監督主要是屬地的行政監督和司法監督。

《司法鑒定執業分類規定(試行)》第四條 法醫病理鑒定：運用法醫病理學的理論和技術，通過尸體外表檢查、尸體解剖檢驗、組織切片觀察、毒物分析和書證審查等，對涉及與法律有關的醫學問題進行鑒定或推斷。其主要內容包括：死亡原因鑒定、死亡方式鑒定、死亡時間推斷、致傷(死)物認定、生前傷與死后傷鑒別、死后個體識別等。